1、土壤消毒
管好育苗床，选用无病健苗移栽定植。移栽时，先在定植穴内施药土。药土的配置是亩用50%多菌灵1千克与50千克细沙土混匀，每穴放上10克左右即可。
2、药剂防治
如棚内发现病株，应及早进行药剂防治。可选用50%多菌灵可湿性粉剂，或50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500倍液，或2.5%咯菌腈悬浮剂1000倍液，或14%络氨铜水剂300倍液等，喷施植株的茎基部;也可用20%甲基立枯磷乳油1200倍液，或30%恶霉灵水剂1000倍液，或50%氯溴异氰尿酸可溶性粉剂1000倍液，或50%DT可湿性粉剂400倍液等进行灌根。
3、根腐病防治的方法比较多，可以通过土壤消毒、药剂防治对根腐病进行防治，还可以通过农业简单倒茬、施用充分腐熟的农家肥、合理灌水等方法来防治根腐病。
