1、第一步：进行发酵剂与干料的混合搅拌。这一步的目的是为了扩大菌种体积，以便更能均匀的掺入到发酵物中。根据发酵原料情况，酌情添加菌种。
2、第二部：将畜禽粪便与混合好的发酵菌剂进行混合堆叠。将发酵物堆放成条垛状，如果是人工做实验，宽度1.5米、堆体高度1米。（注，堆体自然堆放，切忌拍实）让堆体呈自然好氧状态。
3、第三步：水分调节。用辅料调节发酵物的水分，一般湿粪便和辅料的重量比例是3:1-4:1之间，根据原料的水分情况调节。调节好的物料水份应控制在60%左右。利用翻推机进行翻堆、破碎大块、搅拌，翻堆好的物料较蓬松，手握原料，可以成团，松开手，可以散开，这样状态下的原料水分合适，也非常适宜好氧发酵条件。（注：很多朋友做发酵不升温或是腐熟不彻底，做出的肥料有刺激性气味，都跟这一步有关。）
4、第四步：翻堆。原料升温情况：24－48小时堆体内部温度可以升到高温55℃-70℃以上，让温度维持2天，然后再次翻堆，再次堆置发酵，以确保物料均匀发酵，也利于水分扩散。高温发酵上3天基本上可以清除掉粪便臭味。温度上升到70℃左右时，及时翻堆，以减少养分损耗。堆放发酵过程中温度最好控制在55-70度之间。12-15天便可发酵成肥。
5、第五步：发酵效果检测。发酵好的物料水分大概有35%，物料松散无臭味，有淡淡的氨气味，颜色呈褐色、黑褐色，有利于后期深加工。
