1、降雨量减少
黄河流域2000年前风调雨顺，而如今降雨量持续走低，很多地表河流相继干涸消失，导致京杭大运河沿线缺乏充足的水资源补充，最终河道萎缩、淤积，通航条件逐渐衰落。
2、铁路发展
随着陆上铁路成熟，通过铁路时间成本低，单次运输量更大，逐渐替代了内陆河运，而且目前公路体系发达，运输车辆普及，这就更加取代了京杭运河。
3、海运兴起
海运船只吨位更大，沿途省去维护成本，且能够跨国运输，在当前世界贸易普遍的情况下，越发彰显着京杭大运河失去价值。
4、漕运消亡
大运河在古代一个很重要的职能是承办官府漕运，在漕运的基础上衍生出庞大的人流物流，推动运河运输的兴旺和运河沿线经济的繁荣。近代以降，漕运作为封建王朝的产物在近代交通邮传兴起后最终走向消亡，大运河失去了最重要的政治经济支柱，也就逐步走向衰落。
