1、所代表不同
原子数代表的是，当某元素于非单原子状态（分子或化合物）时的数目；
分子数代表的是，某分子的数量，分子中又包含了原子。
例：H2O的原子数目：
H原子数目为两个，O原子数目为一个；
而H2O分子为一个。
2、组成不同
原子由带正电荷的原子核和在原子核的库仑场中运动的带负电的电子组成；
分子是由原子组成的。
扩展资料：
原子是化学反应不可再分的最小微粒。一个正原子包含有一个致密的原子核及若干围绕在原子核周围带负电的电子。而负原子的原子核带负电，周围的负电子带正电。
正原子的原子核由带正电的质子和电中性的中子组成。
分子是物质中能够独立存在的相对稳定并保持该物质物理化学特性的最小单元。分子由原子构成，原子通过一定的作用力，以一定的次序和排列方式结合成分子。
参考资料：百度百科-原子
参考资料：百度百科-分子
