BLAST工具基因序列的生物信息学分析方法

1、首先，使用NCBI对序列进行同源性比对和相似性分析，使用软件DNAMAN5.0和DNAsist20对cDNA序列进行分析得到氨基酸序列。

3、然后，利用绝对荧光定量PCR检测IRF3基因，以pMD18-IRF3a为模板按照质粒提取试剂盒的说明提取质粒。经微量核酸测定仪测定质粒的浓度及纯度，并依据公式:质粒拷贝数=(6.02x1014x质粒浓度)/[(2692+目的基因片段长度)x660][16,计算出质粒的拷贝数。

5、然后，反应在Chromo4Real-TimeDetectionSystem(MJResearch)上进行，实验操作根据GreenTwo-StepqRT-PCRSuperMix荧光定量PCR试剂盒说明进行，反应体系为20μL。