二代测序数据分析：[1]quality control

1、安装fastqc注意将fastqc加入到系统环境变量中，以便于在终端或命令行中直接运行具体安装方法参考fastqc官方手册

2、在命令行中直接运行命令fastqc [-o output dir] [--(no)extract] [-f 熠硒勘唏fastq|bam|sam] [-c contaminant file]output dir指的是输出结果路径extract参数指的是输出结果是否解压-f 参数 是输入文件的格式，指的是测序数据

3、运行fastqc：fastqc seqfile1.fq seqfile2.fq

5、每条序列的测序质量 一般认为90%的reads测序质量在35分以上，则认为该测序质量非常好