一、 药物流产会导致月经失调，抗孕药物可以抑制卵巢的功能，影响卵泡的生长发育甚至排卵。个别妇女药物流产后，可发生月经失调，表现为月经周期缩短或延长，月经量增。
二、 药物流产常会出现流产不完全，有的妇女用药后因不完全流产，影响子宫收缩及子宫内膜创面的修复，使流血量明显增多，超过平时月经量的2-3倍。
三、 药物流产会影响以后的正常妊娠，未婚妇女如反复妊娠、反复流产，可造成子宫内膜反复受损。由于子宫内膜有损伤，一旦她们需要正常妊娠，易发生前置胎盘，可引起产前大出血，也有些妇女由于多次人工流产而出现习惯性流产。
四、 药物流产可导致感染，妇女服用抗孕药物后，子宫腔内的胚囊组织可在当天排出，有时妊娠组织物排出不全，子宫膜复旧欠佳，出血时间较长，可持续2-3周，甚至1-2个月。
