1、不洁性行为所致，这是直接诱发湿疣的主要病因，一般与多个性伴侣发生性关系所患湿疣的几率比单一性伴侣较高，此外，性生活过频也是湿疣的危险因素，首次性交年龄小于19岁者，其发病率及复发率均显著增加，男性商业性工作者是湿疣的高危人群。
2、免疫功能障碍所致，一旦人体免疫力低下就会导致病毒轻易入侵体内，进而滋生，发生病变，由于湿疣患者免疫力比较低下，多伴有其他并发症如糖尿病、艾滋病、肾移植、恶性肿瘤、免疫抑制性化疗和应用糖皮质激素等病人，湿疣的发病率及复发率均显著增加，且疣体体积也较大。
3、不良个人生活习惯，如过量酗酒吸烟等等，这样物质中都会刺激人体机体淋巴细胞的活性，有免疫抑制作用，酒精能抑制中枢神经系统，减轻焦虑，增强性欲，增加高危性行为，在一定程度上增加了湿疣的发生和复发。吸烟能降低机体抵抗力，所以吸烟也是湿疣的危险因素。研究表明，吸烟者湿疣的发病率比不吸烟者高3倍多，且发病率随烟龄和日吸烟支数的增加而增加，同时吸烟会促使湿疣复发。
