1、一、提高水温
小瓜虫天性不耐高温，提高水温历来都是治疗小瓜虫病不错的一种方法，提高水温30°左右，促成表皮脱落，可以配备药物同时进行。
2、二、用干辣椒治疗法
干辣椒用水煮开或者辣椒面，按照每立方米水250克干辣椒比例，对鱼池进行泼洒，每天泼洒1次，连续三天，即可杀死小瓜虫。
3、三、生姜治疗法
准备生姜三斤，加水熬制成生姜水，按每立方米水4毫升生姜水。每天一次，连续三天，间隔五天。
4、四、药物治疗法
按照每立方米水加入亚甲基蓝2克比例稀释的药水泼洒，连续泼洒三次，间隔三天泼洒一次即可。
5、五、红药水治疗。
水中放入一定比例的红药水，不可放多，颜色微红即可，浸泡时间5分钟以上，每天一到两次即可。
6、六、盐水治疗法
用一定比例的食盐水泼洒水中，或将患小瓜虫病的鱼放在食盐：水（1:100）比例的食盐水中，三到五天，可以杀死小瓜虫。
