1、HPV的分型主要依据病毒表面蛋白的DNA序列，到目前已发现的HPV基因型有150余种，而跟性传播疾病相关、感染肛门生殖道粘膜部位的分型有40种以上，依其致病性不同将其分为高危型、中危型和低危型。
2、其中高危和中危型HPV约25种，包括16、18、31、33、35等型，与肿瘤性增生相关，可导致生殖器、肛门恶性肿瘤，如宫颈癌和宫颈上皮内瘤变（CIN），其中大约70%的宫颈癌和阴茎鳞癌发生与HPV16、18型的感染直接相关，针对高危和中危HPV分型的致癌风险评估，2009年，国际癌症研究署定义为三个级别（级别一风险最高，依此类推）：
3、致癌因子：HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59；很可能致癌：HPV68；可能致癌：HPV26、30、34、53、66、67、69、70、73、82、85、97。
